Journal of Cancer Prevention : pISSN 2288-3649 / eISSN 2288-3657

Table. 2.

Table. 2.

Comparison of species frequency of gastric antrum and body mucosal samples

Phylum Species Antrum (%) Body (%)


HP(−) control (n = 2) HP(−) cancer (n = 2) HP(+)control (n = 3) HP(+)cancer (n = 5) HP(−) control (n = 2) HP(−) cancer (n = 2) HP(+)control (n = 3) HP(+)cancer (n = 5)
Firmicutes Streptococcus pseudopneumoniae 0.14 18.68a 3.37a 6.04a 3.80a 23.11a 0.98 0.20
S. mitis 0.02 9.01a 0.51 0.82 0.45 3.09a 0.23 0.00
S. salivarius 0.01 4.00a 0.11 0.40 0.27 6.37a 0.03 0.02
S. infantis 0.32 3.39a 0.24 1.10a 3.07a 5.38a 0.08 0.12
Veillonella atypica 0.03 2.97a 0.23 0.64 0.32 1.22a 0.03 0.01
V. dispar 0.03 2.37a 0.18 0.77 0.53 1.25a 0.05 0.01
Granulicatella adiacens 0.04 3.33a 0.08 0.71 0.51 1.98a 0.03 0.02
Gemella haemolysans 0.00 2.09a 0.19 0.20 0.03 1.16a 0.05 0.01
S. australis 0.05 2.19a 0.14 0.68 0.59 2.01a 0.10 0.01
S. parasanguinis 0.14 1.51a 0.27 0.60 0.86 3.36a 0.14 0.04
S._uc 0.10 1.14a 0.20 0.65 0.76 2.96a 0.06 0.06
GQ130066_s 0.01 0.90 0.21 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00
S. oralis 0.02 1.72a 0.14 0.30 0.50 2.07a 0.08 0.01
Lactobacillus salivarius 0.00 1.93a 0.00 0.05 0.01 0.67 0.00 0.00
S. tigurinus 0.01 1.06a 0.03 0.17 0.25 0.43 0.00 0.00
Solobacterium moorei 0.02 0.17 0.03 0.54 0.01 0.13 0.00 0.02
S. lactarius 0.02 0.88 0.05 0.08 0.14 0.65 0.02 0.00
Megasphaera micronuciformis 0.00 0.70 0.02 0.15 0.03 0.04 0.00 0.00
Streptococcaceae_uc_s 0.02 0.41 0.10 0.11 0.57 1.90a 0.12 0.05
Lactobacillales_uc_s 0.01 0.19 0.02 0.08 0.82 2.09a 0.07 0.05
Proteobacteria HP 0.11 0.11 86.47a 60.30a 0.42 0.10 89.78a 75.93a
Haemophilus parainfluenzae 0.15 3.84a 0.46 0.96 2.15a 2.41a 0.13 0.02
Escherichia coli group 0.03 0.00 0.00 1.46a 0.00 0.01 0.00 0.05
H. paraphrohaemolyticus 0.00 1.60a 0.08 0.60 0.03 1.10a 0.02 0.01
Methylobacterium adhaesivum 0.06 2.22a 0.12 0.56 0.06 0.00 0.00 0.05
Bradyrhizobium jicamae 0.00 0.07 0.01 0.22 8.66a 0.68 0.24 1.24a
Neisseria perflava 0.00 4.24a 1.14a 0.17 0.04 5.12a 0.04 0.02
Pseudomonas beteli 1.05a 0.05 0.01 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00
P. hibiscicola 44.87a 0.06 0.24 0.17 0.00 0.02 0.00 0.01
Helicobacteraceae_uc_s 0.01 0.00 0.08 0.07 0.06 0.03 1.28a 0.49
H._uc 0.00 1.00a 0.07 0.11 0.09 0.86 0.04 0.00
Aggregatibacter segnis 0.02 1.07a 0.00 0.05 0.00 0.44 0.00 0.01
H. haemolyticus 0.00 0.61 0.10 0.04 0.04 0.53 0.04 0.00
Ralstonia pickettii 45.90a 0.05 0.02 0.04 0.03 0.00 0.00 0.00
Pasteurellaceae_uc_s 0.01 0.19 0.02 0.03 0.36 0.69 0.02 0.01
Pasteurellales_uc_s 0.00 0.04 0.01 0.02 0.12 0.63 0.00 0.01
B. pachyrhizi 0.00 0.01 0.00 0.03 5.33a 0.49 0.11 0.70
Klebsiella pneumoniae 0.00 0.07 0.00 1.05a 0.00 0.02 0.00 0.03
Neisseriaceae_uc_s 0.00 0.22 0.00 0.02 0.05 0.60 0.00 0.00
Neisseriales_uc_s 0.01 0.05 0.01 0.01 0.08 0.80 0.00 0.00
FJ269053_s 0.02 0.08 0.00 0.01 14.23a 1.38a 0.46 2.94a
B. denitrificans 0.00 0.07 0.00 0.00 1.14a 0.09 0.03 0.10
U87765_s 0.02 0.02 0.00 0.00 2.97a 0.27 0.08 0.51
Bradyrhizobiaceae_uc_s 0.00 0.00 0.00 0.01 0.98 0.20 0.04 0.13
DQ532251_g_uc 0.00 0.00 0.00 0.00 0.79 0.09 0.03 0.18
Pelomonas saccharophila 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26a 0.47 0.22 0.95
Rhizobium hainanense 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10a 0.11 0.04 0.24
M. longum 0.00 0.00 0.00 0.00 1.91a 0.09 0.06 0.40
M. radiotolerans 0.01 0.00 0.00 0.00 3.08a 0.18 0.11 0.62
B._g1_uc 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 0.09 0.02 0.09
Bacteroidetes Prevotella histicola 0.01 3.08a 0.11 0.43 0.11 1.85a 0.08 0.00
P. melaninogenica 0.01 1.56a 0.06 0.84 0.14 0.92 0.04 0.02
P._uc 0.01 1.07a 0.23 0.31 0.21 0.98 0.06 0.01
P. pallens 0.02 0.65 0.08 0.33 0.03 0.31 0.00 0.02
P. salivae 0.00 0.78 0.06 0.14 0.05 0.46 0.02 0.01
EF123551_g_uc 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45a 0.11 0.07 0.51
Actinobacteria Propionibacterium acnes 1.43a 0.42 0.82 4.42a 8.49a 1.39a 0.27 4.34a
Actinomyces odontolyticus 0.05 1.31a 0.17 0.89 0.44 0.95 0.12 0.03
Rothia mucilaginosa 0.09 0.26 0.07 0.12 0.90 0.09 0.05 0.01
Propionibacterium_uc 0.02 0.01 0.01 0.04 0.53 0.07 0.01 0.07
Propionibacteriaceae_uc_s 0.04 0.00 0.00 0.02 0.79 0.18 0.04 0.16
Viridiplantae Prunus persica 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.83
Nicotiana tabacum 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09a 0.00 0.00 0.05
Ipomoea purpurea 0.00 0.00 0.00 0.00 1.59a 0.00 0.00 0.00
Fusobacteria Fusobacterium nucleatum 0.09 0.92 0.26 0.11 0.33 0.16 0.08 0.03

Values are presented as mean percent. HP, Helicobacter pylori.

This means cut off > 1.0.

Journal of Cancer Prevention 2017;22:115-25 https://doi.org/10.15430/JCP.2017.22.2.115
© 2017 Journal of Cancer Prevention